En 1973, se llevó a cabo un Comité Asesor, con el propósito de estructurar un área encargada de ofrecer estudios de posgrado, así como de fomentar el diseño y desarrollo de proyectos de investigación. En 1974, se iniciaron las actividades en la anteriormente llamada Sección de Estudios de Graduados e Investigación, en las áreas de Ingeniería. Informática, Economía y Administración. En 1975 se inicio el primer programa interdisciplinario de maestría: Maestría en Administración con Especialidad en Análisis de Decisiones, con una matrícula de 52 alumnos. Actualmente, llamada la Sección de Estudios de Posgrado e Investigación (SEPI), cuenta con 4 programas de maestría: Maestría en Administración perteneciente al Programa Nacional de Posgrados de Calidad del CONACYT, Maestría en Ingeniería Industrial, Maestría en Ciencias en Informática y Maestría en Ciencias en Estudios Interdisciplinarios para Pequeñas y Medianas Empresas.