Los alumnos aceptados en el programa podrán solicitar la Beca Institucional. Los alumnos aceptados al Programa que participen en proyectos de investigación de la Secretaría de Investigación y Posgrado (SIP) del IPN, podrán solicitar Beca PIFI (Programa Institucional de Formación de Investigadores), en ambos semestres de ingreso al Programa.
Estos apoyos otorgados por el IPN están sujetos a las disposiciones y plazos de admisión establecidos por la reglamentación de cada uno de los sistemas. Además, los alumnos aceptados al Programa que se integren a proyectos de investigación vinculados, podrá recibir estímulos complementarios.
El Doctorado contempla que el alumno curse asignaturas de su plan individual de estudios o efectúe estancias de investigación en cualquiera de las UA participantes en el programa doctoral, o bien en el extranjero, mecanismo que además es congruente con el Reglamento de Estudios de Posgrado del Instituto. En paralelo, los alumnos trabajan bajo la dirección de dos investigadores, por lo que desarrollan su trabajo en al menos dos sedes, donde están adscritos los directores. Los profesores participantes del programa fomentan la movilidad de los estudiantes, la cual se coordina y financia a través de los mecanismos institucionales y sus convenios, como son las Becas de Movilidad del IPN, ECOES, ANUIIES, y/o mediante recursos de proyectos de los directores de tesis.