Al ser un programa de investigación, se pretende que el alumno se encuentre en contacto permanente con el/la directora de la tesis y el comité tutorial. En este sentido, las asignaturas obligatorias son las de Seminario y en las cuales se busca que los alumnos conozcan y aporten a los trabajos de sus compañeros, además de asignaturas que homologan el conocimiento de los alumnos y le dan los fundamentos para su investigación y para proyectarse hacia asignaturas optativas. Las asignaturas optativas deben ser una de carácter teórico y en donde el énfasis se encuentra en la construcción conceptual de la investigación y otra metodológica que como su nombre lo indica permitirá al alumno llevar a cabo su investigación respetando los criterios del método científico.

A las asignaturas obligatorias y optativas se le acompañan una serie de actividades importantes en la consecución del objetivo de formar investigadores sobresalientes en el área: la publicación de por lo menos un artículo científico en una revista de prestigio y la presentación en eventos académicos. Cabe mencionar que estas actividades son obligatorias.

El programa incluye 4 seminarios con 2 créditos cada uno, 4 unidades de aprendizaje obligatorias de 6 créditos por cada una de ellas; cuatro unidades de aprendizaje optativas de 6 créditos cada una y 4 trabajos de tesis. En total el programa se compone de 56 créditos de acuerdo al Reglamento de Estudios de Posgrado vigente (al 15 de enero de 2014). Adicionalmente se plantea una estancia del alumno ya sea en los sectores público o productivo, en una organización social o bien en otra institución académica. Como actividades complementarias también se plantea la acreditación de dos cursos semestrales de redacción en inglés, una ponencia en un foro académico y la publicación de un artículo en una revista de calidad internacional. En caso de ser aprobado un nuevo reglamento la comisión proponente realizará las adecuaciones pertinentes. En este documento se presenta una versión alternativa acorde a la propuesta de reglamento de posgrado que se discute actualmente en el IPN, en esta versión se da mayor peso curricular y más créditos al trabajo de tesis.